厭氧箱可在箱內操作和培養最難生長的厭氧生物，在理想的厭氧環境下氧氣濃度可達5ppm以下。操作室與培養室相互獨立，避免像一般箱中悶熱空氣對操作者的不適影響。大容量獨立培養室培養效果更理想；并可通過控制面板指示燈及真空壓力表來查看箱內的厭氧狀況。
標本收集與處理
1.采集原則
1）在疾病早期或癥狀、體征明顯時，在抗生素使用之前采集。
2）一般選擇深部的膿液或組織，以穿刺或手術方法采集標本。
3）標本標明病人的姓名、住院號、來源、特殊部位、采集日期、時間和最初的采集者。
4）標本放在無菌并且有利于可疑病原菌生長的容器內，防止滲漏和潛在的安全隱患。本實驗室推薦用無菌針管抽取后排除氣體，用無菌橡皮塞封住針頭后立即送檢
2.厭氧箱具體采樣要求
1）從正常無菌部位或通過嚴格無菌操作采取，如血液、胸腔液、腹腔液、心包積液、CSF、關節液以及通過外科無菌手術或穿刺抽得膿液，或通過特殊技術如纖維支氣管鏡取得下呼吸道標本及由陰道后窟窿穿刺抽得盆腔膿液等。采集和運輸過程中應避免接觸空氣，及時送檢。
2）經口吐出的痰不能避免咽喉部正常菌群感染，不適宜做厭氧菌培養。可用纖維支氣管鏡采集。人工氣道如氣管切開或氣管插管患者，可用吸痰管理經人工氣道口插至葉支氣管水平吸引痰液。
3.樣品拒收標準
1）使用不合格的容器：有滲漏、污染或非無菌的容器。
2）申請單不符合要求：無姓名、住院/門診號，無檢驗目的，檢驗目的與標本不符合。
3）標本不符合要求：未與空氣隔絕，要求做厭氧菌培養，經口吐出的痰要求做厭氧菌培養。采樣至送檢超過2小時而未用運用培養基等。
4.厭氧箱樣品的處理
厭氧菌在適當的培養基上，經35℃、厭氧環境（80%N2、10%H2、10%CO2）下孵育48~72小時,經涂片染色、菌落特征、耐氧試驗、生化反應等作出鑒定。
